ChemBio3D Ultra是一款化学结构式画图软件，通过观察3D分子模拟图形，研究化合物的三维结构，预测化合物属性和特异性，在ChemDraw里搭建有机小分子、观察3D结构。

　　软件特色

　　1、可视化建模

　　通过3d建模、可视化和计算等功能，科学家能够更好、更快地确定出研究重点，从而提高生产力，快速达成研究目标。学生则可以使用ChemBio3D Ultra官方版更加深入地认识分子的3D空间结构及对其属性所产生的影响。

　　2、2D与3D模式结构互换

　　ChemBio 3D集成ChemBioDraw，可简化2D和3D模式之间的结构互换，科学家能够研究小分子和生化制剂的三维形状及属性，并且使合成化学家与计算化学家之间的交流更有效和开放。

　　3、丰富的应用接口

　　ChemBio 3D经济实用，充分满足大多数科学工作者的需求，同时也能提供与其它应用程序的接口，满足用户对更高级功能的需求。这款程序在普通桌面系统上即可运行，无需配备高性能和高端制图功能的系统。

　　4、兼容多款程序、准确预测结果

　　ChemBio 3D包括多个可选版本，如半经验建模程序MOPAC、半经验和从头开始的Gaussian分子轨道计算，并可连接到从头计算程序GAMESS以及可处理柔性配体的自动对接程序AutoDock。

　　功能介绍

　　3D眼镜

　　(W)包括眼镜提供增强的立体声模式与深度的阴影，给现实的三维效果图质量的所有结构。(包括在光盘购买而已。)

　　自动覆盖

　　(W)选择多个分子结构，自动对齐靶分子。

　　ChemDraw盗链

　　(W)同时2D和3D编辑!使用ChemDraw窗口嵌入在Chem3D画结构的应用。这个强大的功能，增加了一个二维视图，总是在3D视图同步。

　　chemprop

　　(W)先进的性能参数包括BP、MP和更多。

　　ClogP

　　(W)ClogP产权服务器提供计算的正辛醇/水分配系数的新方法。

　　二面角驱动

　　(W)新的构象分析工具允许MM2能量图的生成。

　　增强的图形

　　(W)c hem3d使用OpenGL提供高质量的图形显示。

　　正式指控

　　(W)分配形式电荷原子和结构将产生离域自动充电。

　　GAMESS接口

　　(W)结构的界面会。

　　组标签

　　(W)在结构模型视图显示组的标签。

　　氢键

　　(W)自动显示氢键在3D视图!

　　凯库勒/异于寻常的显示模式

　　(W)之间的虚线和交替的离域和芳香键单双键表示切换。

　　逻辑

　　计算分配系数D值的对数，这是所有形式的化合物的浓度之和的比值(电离和非离子化)在一个阶段。

　　日志

　　计算一个化合物的溶解度值的对数。这个值显著影响其吸收和分布特征。

　　mm2

　　(W)内置mm2生成逼真的三维结构的支持。

　　MMFF94

　　(W)MMFF94是分子力学力场支持有机分子和生物大分子。MMFF94力场提供更丰富的原子类型设置为。使MMFF94计算多处理器支持。

　　模型资源管理器

　　(W)为探索大型模型的分层树结构的控制。进口Pdb文件和检查链，组，和配体。这个新功能提供了细粒度的控制。

　　分子建模与动力学

　　(W)工作站质量的分子模拟。

　　MOPAC接口

　　(W)接口的异构结构。(注：MOPAC应用要求。见应用包括部分澄清。)

　　支援多重处理器

　　使MMFF94计算多处理器支持。

　　局部表面

　　(W)生成和显示对蛋白质的活性位点的局部表面。

　　PKA

　　计算出的酸离解常数Ka值的对数，这就是溶液中酸的强度的定量测量。

　　幻灯片演示文稿软件

　　(W)嵌入结构模型在PowerPoint文件。旋转和缩放结构模型演示文稿时。

　　保存到Dropbox

　　使用云存储通过Dropbox保存在一个安全的可共享的云的位置共享和进口chembio3d模型。

　　Schr dinger捷豹?接口

　　(W)接口?薛定谔薛定谔Chem3D捷豹，从头计算软件包。(注：捷豹的应用要求。见应用包括部分澄清。)

　　光谱分析仪

　　(W)显示来自捷豹，高斯谱的计算结果，并会在单独的窗口中的图形显示。

　　随机构象分析

　　使用随机构象跳跃法测定分子的低能量极小。

　　结构浏览器

　　(W)可以让用户轻松浏览一系列的小分子和比较它们的结构和性质。